原标题：GOplot-画出别样的GO富集分析图

各位医学方的朋友大家好。今天我们聊一聊富集分析说到富集分析，你会想到KEGG或者GO富集分析GO实际上是GeneOntology两个单词的首字母简写，主要包括BPMF，CC三个部分分别代表的是生物学过程，分子功能和细胞定位富集分析结果展示的时候，我们一般会画气泡图或者条形图如下：

但是如果，我们想画出别样的风格怎麽办呢

那么今天，我们就推出我们的利器-GOplot包该包主要是对GO富集结果进行可视化，不能进行富集汾析那我们聊聊该包到底具有哪些功能？可以画出什么样的图形

瞬间有没有找到心动的感觉？

下面进入正题今天我们看看如何用富集分析的结果，进行GO可视化：

安装并加载包关于包的安装，已经讲过多次直接上代码：

GO富集分析，这次利用clusterProfiler包进行富集分析当然你還需要安装该包并加载：

用内置数据集进行GO富集分析：

注意体会readable参数的意义，该参数的设置可以是的GO富集的结果的gene以gene symbol形式出现。

整理成GOplot所需要的输入格式文件

整理gene的信息该信息要包括两列信息，分别是gene的Symbol还有就是gene的logFC值

构造和弦图需要的输入数据结构，首先是构建一个list對象接着用circle_dat构建画图的对象circ2，接着用chord_dat构造chord对象注意在process用了一个unique函数：

chord构建好之后，便可以轻松画图了如下：

Ok，今天的推文就到这峩们分享了如何在基于clusterProfiler下，进行GO富集分析以及利用该GO富集结果进行GOplot可视化当然了，关于该包的具体使用我们医学方推出了详细课程，具体讲解代码的含义以及如何进行其他图形的绘制比如气泡图，聚类图等更是如何根据自己的数据如何进行操作整理，画出你满意的GO富集图形最后，欢迎大家留言有不正确的地方，也请大家留言指正

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