如何获得已知抗性质粒的抗性基因序列?我手里有一个质粒pKOGEG,已知其具有氯霉素抗性,我也可以通过测序测定其全基因序列。现在我想利用其氯霉素抗性基因序列，请问如何获得？求教了！_作业帮
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如何获得已知抗性质粒的抗性基因序列?我手里有一个质粒pKOGEG,已知其具有氯霉素抗性,我也可以通过测序测定其全基因序列。现在我想利用其氯霉素抗性基因序列，请问如何获得？求教了！
如何获得已知抗性质粒的抗性基因序列?我手里有一个质粒pKOGEG,已知其具有氯霉素抗性,我也可以通过测序测定其全基因序列。现在我想利用其氯霉素抗性基因序列，请问如何获得？求教了！谢谢！
在NCBI里查找你所要的基因序列信息，然后给外面的基因公司让他们合成。 www.ncbi.nlm.nih.gov/ Entrez|/|/|/|/|/|
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【求助】如何获得基因序列
新手上路,请教如何在NCBI上找到自己想找的基因序列,如要找GeneID: 418544序列.进入www.ncbi.nlm.nih.gov然后再下拉框选gene,填入基因名即可。我一般都是选择Nucleotide进行序列的查找。以下mRNA序列的相应DNA是不是GeneID:418545?我还是没有找到.请帮帮忙.LOCUS
VRT 16-NOV-2006DEFINITION
PREDICTED: Gallus gallus similar to cystathionine beta-synthase
(LOC418545), mRNA.
........ gene
/gene="LOC418545"
/note="Derived by automated computational analysis using
gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence
includes similarity to: 1 mRNA, 2 ESTs, 4 Proteins"
/db_xref="GeneID:418545"应该就是这个啦我在PUBMED中选择gene输入418545 就得到了。1: LOC418545
Links similar to cystathionine beta-synthase [Gallus gallus] Chromosome: 1 GeneID: 418545 然后你直接点击 LOC418545 就可以得到该基因的详细信息了。应该就是你所写的那些。我进去了,得到的是:LOCUS
CON 16-NOV-2006DEFINITION
Gallus gallus chromosome 1 genomic contig, reference assembly
(based on Gallus_gallus-2.1).好象不是cystathionine beta-synthase [Gallus gallus] 基因?应该就是你要的这是第一条染色体的全部序列信息我急需构建质粒，需要mus NPC1mu序列设计引物进行RT-PCR,请各位高手帮忙！llfdnhh wrote:我进去了,得到的是:LOCUS
CON 16-NOV-2006DEFINITION
Gallus gallus chromosome 1 genomic contig, reference assembly
(based on Gallus_gallus-2.1).好象不是cystathionine beta-synthase [Gallus gallus] 基因?这应该是GENOMIC DNA。不是你要的基因。我也认为是GENOMIC DNA的部分,通过比对应该的到我要的基因,可是我在NCBI上进行BLAST,得到的信息比较零乱,谁知道更好的办法?用什么软件?如何操作?
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我想查大肠杆菌DH5alpha的全序列，可是不知道怎么操作...忘厉害的你们帮忙告诉我......谢谢
提问者： [] [] []
回答者： [] [] []
一级 一星助者
&据我所知，应该没有5alpha的全基因组序列。大肠杆菌已经发表的可以参看以下网址：
可以根据K12的序列以及一般教科书上给的5alpha的genotype，得到自制的genome seq
不知有否帮助！
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其他回答 (1)
由E.coli AS1.76克隆了青霉素G酰化酶的基因,并且测定了其全部核苷酸序列。青霉素G酰化酶结构基因是由下述功能片段组成的:(1)编码信号肽(26个氨基酸残基)的78个碱基对;(2)编码&-亚基(209个氨基酸残基)的627个碱基对;(3)编码间隔肽(54个氨基酸残基)的162个碱基对;(4)编码&亚基(557个氨基酸残基)的1671个碱基对。此外,我们还发现起始密码子(ATG)前有个核糖体结合位点和启动子序列以及在终止密码子(TAA)之后有个转录终止信号。与最近发表的青霉素G酰化酶基因的DNA序列比较,同源性达99.7%。
/ 青霉素e酚化酶〔(penieillin G Acylase,PGA),Ec 3 .5 .1 .11]是广泛存在于微生物中的一种去酸基化酶。它水解青霉素G产生6-氨基青霉素烷酸(6一ApA)及苯乙酸,并能催化其逆反应〔&&。6一APA是半合成青霉素不可缺少的重要原料。因此,青霉素G酞化酶对于半合成卜内酞按类抗生素
　Some of microorganisms have been knownto possess penicillin G acylase activity.The E.coli derived penicillin G acylase(PGA) can catalyze the conversion of peni-cillin G into phenylacetic acid and 6-amino-penicillanic acid,the latter is used as thestarting compound for the industrial forma-tion of semi-synthetic penicillins.Apart fromits industrial importance,the enzyme PGAdisplays a number of interesting properties.Catalytically active enzyme is localized inthe periplasmic space of E.coli cells andcomposed of two dissimilar subunits.Thetwo subunits are apparently produced from aprecursor protein,via a processing pathwayhitherto unique in its features for a prokary-otic enzyme.The studies on processing ofthe precursor and on the relationship betweenstructure and function of the mature enzymeare important theoretically. Previously we cloned a 3.5 kb DNAfragment from a strain (E.coli AS 1.76),which displays PGA activity.In this paper,we report a nucleotide sequence of the 3.5kb DNA fragment containing PGA gene.After insertion of the DNA fragment intoEcoR Ⅰ and Hind Ⅲ sites in pWR 13,pPGA 20 had been obtained.We subclonedthe Hind Ⅲ and Bgl Ⅱ treated fragment of1.6 kb in length from pPGA 20 into HindⅢ and BamH Ⅰ sites of pWR 13 to get apPGA 1.6.and Bgl Ⅱ and EcoR Ⅰ treatedfragment of 1.9 kb in length into BamH Ⅰand EcoR Ⅰ sites of pWR 13 to get a pPGA1.9.The linearized pPGA 1.9 which weredigested with appropriate restriction enzymeswere progressively shortened from both endsrespectively by digestion with Bal 31 nu-clease,followed by cleavage of shortened tar-get DNA off vector DNA molcules with ap-proriate restriction enzymes.The series ofthe DNA fragments shortened from EcoR Ⅰend were then cloned into plasmid pWR 13which had previously digested with Hind Ⅲand Sma Ⅰ enzymes (Fig.1).The DNA frag-ment cloned in pWR 13 were directly se-quenced on the resulted plasmids by usingprimer Ⅰ and primer Ⅱ.Thus we have ob-tained the complete nucleotide sequence ofthe 3.5 kb DNA fragment. The 3.5 kb fragment contains an in-tact PGA gene which is 2.6 kb.The openreading frame in the gene consists of fourstructural domains:(i) nucleotide positionsNo.53&130 coding for a signal peptide of theprecusor enzyme,(ii) positions No.131&757coding for alpha-subunit of the mature en-zyme,(iii) positions No.758&919 coding forthe spacer peptide of the precusor enzyme,(iv) positions No.920&2590 coding for beta-subunit of the mature enzyme.Additionallyupstream from the starting codon ATG,thereis a promoter and a PBS (i,e.SD) sequen-ce,and downstream sequence from termina-tion codon TAA,there is a terminator.(Fig.3).
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回答者： 一级 一星助者
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怎样知道病毒的基因序列，例如乙肝病毒，或者大肠杆菌病毒
我是做生物电化学分析的，老师让用电化学的方法检测病毒DNA，从来没做过，看过一些文献上面有许多DNA 碱基序列，但有没有说是病毒的DNA序列，我想知道怎样知道病毒的碱基序列或基因组？从那里可以获得这样的信息？或者可以直接购买呢？我有问过一些公司合成DNA碱基序列的，他们都要求我给他们明确的碱基序列才可以合成，可我完全不知道乙肝病毒或大肠杆菌的病毒基因序列，怎样获得？怎么办啊？求知道的告知。谢谢。:hand:
你可以到genebank这个网站上搜索。 一般来说，基因组都比较庞大，可以通过NCBI上的genebank来搜索你想要的基因序列，资源极其丰富，其官网为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/，楼主刚才提到到的乙肝病毒的基因组就可以通过此链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/X51970.1查到。 比如乙肝病毒
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/?term=hepatitis+b+virus
genome下面有1个,点击
有个FASTA 的链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?report=fasta，就可以得到基因组序列了。 : Originally posted by shyh1983 at
一般来说，基因组都比较庞大，可以通过NCBI上的genebank来搜索你想要的基因序列，资源极其丰富，其官网为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/，楼主刚才提到到的乙肝病毒的基因组就可以通过此链接http://www.ncbi.nlm.n ... 谢谢回复，十分受用}