创始人石美玉医师。1873年生于湖北黄梅是我國医学界最早留学美国的女医师，1896年毕业于密执安（Michigan）大学归国后在九江创办但福医院及护士学校，并任中华医学会副会长1920年自九江來上海第九人民医院整形创办伯特利医院（九院前身）。

1920年石美玉医师与其友人胡遵理教士自九江来上海第九人民医院整形并创办伯特利教会。作为教会事工之一她们在制造局路565号设立医院、护士学校，并相继设立小学、礼拜堂及孤儿院等机构由石美玉负责。1922年石媄玉等买下制造局路639号内的几间民房，并对邻近的39亩荒地进行改造修建医院这就是九院的前身。当时有9名医生、6名护士、3名职工

1938年5月，遂在当时的法国租界内的复兴西路21号（原名伯赛仲路）租用房屋设立分院在八仙桥西藏南路169号设立诊所。

1945年抗日战争胜利后伯特利總院陆续复原。石成志代院长梅国贞医务主任主持医院工作。1949年病床增至60张，增设儿科、眼科、牙科、骨科1951年伯特利医院一致请求政府接办医院，并订立爱国公约同年8月，上海第九人民医院整形市人民政府派军代表正式接管伯特利医院

1952年12月，伯特利医院更名为上海第九人民医院整形市第九人民医院分院和诊所相继停止业务。1957年1月第九人民医院划归为上海第九人民医院整形第二医学院作为儿科系教学基地。1958年10月第二医学院将儿科系调整到新华医院，九院重新划归市卫生局属蓬莱区领导。

1964年第九人民医院再次划归上海第九囚民医院整形第二医学院，作为口腔系教学基地并陆续由瑞金及仁济医院抽调医务人员充实九院。

1965年12月口腔医学系教学实习基地从广慈医院（瑞金医院前身）迁至上海第九人民医院整形第九人民医院。上海第九人民医院整形第九人民医院正式列为上海第九人民医院整形苐二医学院口腔系教学医院

1985年6月15日，经上海第九人民医院整形市人民政府批准上海第九人民医院整形第二医学院改名为上海第九人民醫院整形第二医科大学，医院更名为上海第九人民医院整形第二医科大学附属第九人民医院1987年上海第九人民医院整形第二医科大学口腔醫学系改名为上海第九人民医院整形第二医科大学口腔医学院，同年成立上海第九人民医院整形市口腔医学研究所。1989年又成立上海第九囚民医院整形市生物材料研究测试中心

位于虹梅路华光路口的虹梅口腔门诊疗部于2004年开张。

上海第九人民医院整形第九医院家信医疗美容门诊部

上海第九人民医院整形第九人民医院是上海第九人民医院整形第二医科大学的附属医院是以整形美容、口腔及皮肤激光等为特色的三级甲等综合性医院。