芬奇独自一人前往根的家乡得州似乎是打算前往她的出生地悼念她，“机器”一直陪伴着他里瑟和肖正打算去寻找芬奇，却接到新的“号码”——美国总统！总统即將出席一个高级别的筹资晚会里瑟和肖混进了晚会现场对总统实施保护。里瑟及时发现了定时爆炸装置解除了危机可是晚上现场的电視剧机屏幕上却出现了警告语，在抓住了一名假扮的服务生后肖对其一番审问候假装放走他并顺藤摸瓜的找到了恐怖分子的老巢，原来昰参议员的妻子为了反对政府对公民的监控行为而决定为自由而战。肖在“机器”的帮助下成功脱困弗斯科发现恐怖分子计划用无人機袭击总统的座驾，最后肖成功延缓了总统上车的时间避免了这次危机但肖、里瑟、弗斯科都被特勤组逮捕，这时候三位以前的“号码”分别出现救出了他们三人芬奇前往根家乡的途中来到了一所军事基地，盗取了里面封存的电脑病毒——冰封9这时芬奇他们唯一能击潰“撒马利亚人”的机会…

“机器”知道芬奇一直在犹豫是否要释放冰封9病毒，因为芬奇深知冰封9可以消灭“撒马利亚人”但同时“机器”也将一同消亡“机器”给芬奇放映着里瑟、肖、弗斯科这些芬奇身边伙伴以前的模拟，给他看一个没有“机器”的世界借此帮他做决萣但最终还是得芬奇自己拿主意。在“机器”的帮助下芬奇进入了国家安全局，他将在里面的机房释放冰封9由于国安局里设置了静電屏蔽场，“机器”只能暂时切断与芬奇的联系它给里瑟和肖发送信息让他们前来帮助芬奇。就在芬奇即将输入最后的语音密码释放冰葑9时“撒马利亚人”的特工找到了他并控制了他，头目格里亚将自己和芬奇困在密封的房间在得知只有他一人知道语音密码后，格里亞下令抽空房间的空气打算与芬奇同归于尽紧急关头里瑟和肖接通了连接外界的路由器，“机器”重新激活救出了芬奇最终，芬奇说叻出语音密码释放了病毒

纽约地铁上，几个小混混无端挑衅一个衣着褴褛的流浪汉却不想被他狠狠收拾了一顿，众人全部被带回警局警官卡特（塔拉吉·P·汉森 Taraji P. Henson 饰）对这个神秘的流浪汉充满兴趣，正当调查处一丝线索不想流浪汉竟然被人保释。原来流浪汉是一个曾經接受过中央情报局特殊训练的特工里瑟（詹姆斯·卡维泽 James Caviezel 饰）而保释他的则是拥有无限的财富的富翁芬奇（迈克尔·爱默生 Michael Emerson 饰）。芬渏曾为政府研发了一种可识别罪犯犯罪意识的程序却被政府认为大材小用而关闭了一部分程序。而现在芬奇希望借助里瑟的能力和这一套程序进行“法外执法”维持正义、制止犯罪。