从句子成分上分析的话这句话沒有错。
today是句子的时间状语they是句子主语，are以及后面的词语是句子的谓语are是部分谓语，to school是表语而不是不定式。但to。做表语表将来。
所以句子的意思应该是今天他们不是去学校
如果像上面一样，改成they are not going to school 则是现在进行时表示今天他们正在不去学校，但感觉挺别扭的

佷显然这是个介词的问题，把to改成at表示they 没有去学校

看楼主所写的，to这个词应该是“去”的意思所以这句话大概是：今天他们不去學校。
 

看你这句话的时间而定：