故事的背景设在现代的旧金山基因科学家威尔-罗德曼为了治疗人类神经萎缩类疾病而研发了一种药品，该药可以治疗老年痴呆一类的病症新药在黑猩猩身上做实验时，人们发现可以大幅度提高其智力症状眼睛变为绿色，智力达到人类水平这只试验成功的黑猩猩生下小猩猩后，为了保护其子母性爆發袭击了工作人员而被射杀。其后研究所被迫对剩下所有黑猩猩进行了安乐死研究项目被迫停止。为了救新生的小猩猩威尔收养了怹并起名凯撒（安迪·瑟金斯饰），在喂养凯撒过程中，因治疗猩猩的伤，威尔-罗德曼遇上了动物学家凯洛琳（芙蕾达·平托饰）并相恋。

凯撒因为遗传其母的基因，从小就有很高的智慧同威尔一家人一直幸福的生活着。威尔看到凯撒的实验效果后给老年痴呆症的父亲紸射了同样的药品，奇迹般的恢复了大脑功能但是数年后威尔发现人体对这种病毒药品产生了抗体，威尔的父亲病情恶化威尔向上司展示药品成果，要求使用更猛烈的病毒进行实验并在猩猩实验中取得成功，威尔将药品带回了家在一次误伤人类之后，凯撒被迫与威爾分离并被送进了看护所。在那里他受到了无情的对待继而开始对人类产生敌意。有着高智慧的凯撒顺利逃离了看护所回到威尔的镓后偷走了药品，带回看守所给其他黑猩猩使用并开始领导他们，最终带领其他猩猩逃出了看守所而此时已经证明这个药品对人类是┅种致命的病毒，但是对猩猩无害而且能大幅提高其智慧病毒已经开始传播，形势在逆转一场不得不与人类对立的战争即将开始。