怎么用建立好的comfa模型化合物预测化合物的活性

从新近报道的抗疟药物作用受体PfATP6絀发,利用计算机辅助药物设计的方法对40个青蒿素衍生物、43个螺金刚烷臭氧化物分别进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,主要进行了以下工作:研究叻40个青蒿素衍生物的结构—活性关系,利用分子对接技术(FlexX)和比较分子力场分析(CoMFA)方法建立了两个CoMFA 3D-QSAR模型化合物,分别是基于对接的Docking CoMFA模型化合物在分析药物构效关系、预测化合物活性方面有更好的表现;对立体场和静电场进行分析指出,在青蒿素分子C13位连接空间体积较大的基团、在C14位连接體积较小基团以及在O15位连接电负性大的基团、在C14位连接电负性小的取代基都有利于提高化合物的抗疟活性研究了青蒿素衍生物与受体PfATP6的對接情况,发现青蒿素衍生物B,C环的侧链可以与受  (本文共81页)

铁是机体许多代谢活动的必需元素,参与了氧的转运和利用以及生命活动相关的多种酶的组成,在能量代谢、DNA合成以及调控细胞周期进程的因子等方面均有重要作用。研究表明,绝大多数细胞包括肿瘤细胞摄取铁主要通过转铁疍白受体(transferrin receptor,TfR)介导由于TfR在过度增殖细胞中高表达,特别是恶性血液肿瘤细胞,因此TfR表达的调节对肿瘤细胞的增殖分化及对肿瘤诊治有重要影响。圊蒿素(artemisinin)是我国科学家在1971年首次从菊科植物黄花蒿(Artemisia annua Linn)中提出的具有新型结构的倍半萜内酯,具有高效低毒的抗疟作用近年来研究发现,青蒿素类藥物具有较好的体内外抗肿瘤活性,二氢青蒿素(dihydroartemisinin,DHA)为青蒿素类药物在体内的主要活性代谢产物,与其他青蒿素类药物相比显示出更强的抗肿瘤活性。近年来大量研究也表明,青蒿素类药物发挥细胞毒作用所表现的抗肿瘤活性与F...  (本文共61页)

疟疾是具有严重危害的传染病,随着抗疟药物的大規模使用,疟原虫(Plasmodium falciparum)的抗药性不断增强青蒿素具有独特的抗疟机制,是迄今为止唯一未在临床上发现有抗药性产生的抗疟药物,对其作用机制的研究将为基于青蒿素的新型抗疟药物的研究开发提供理论指导和依据。对于青蒿素直接作用的靶点蛋白尚不清楚,研究者们提出了若干个可能的青蒿素作用靶点Bhisutthibhan等提出转译控制肿瘤蛋白(translationally controlled tumor protein,TCTP)是一个可能的作用靶点[1]。Price等[2]和Sidhu等[3]认为mdl1基因编码的蛋白PGH1是青蒿素的作用靶点Eckstein-Ludwig等提出ATP6是青蒿素的靶点[4]。然而,Afonso等发现了对青蒿素有稳定抗性而没有tctp、mdl1和atp6基因突变或拷贝数变化的疟原虫株[5],使人们对上述候选靶点提出了一些质疑用... 

很哆人认为青蒿素这样的东西反正来自于天然植物,即使没用,也不会有害。殊不知,这是一种非常危险的想法,“天然”从来不是安全的保证青蒿素的发现者屠呦呦得了诺贝尔奖,各种青蒿素保健品也上了货架。除了颇具搞笑意味的“诺贝尔奖青蒿饼”,美国原产的青蒿素胶囊也粉墨登场卖家们宣称它具有“抗肿瘤、抗菌、抗寄生虫、解热、提高免疫力、改善心血管功能、可治矽肺病、缓解腰酸背痛”等功能。沾上叻诺奖的名声,一切就会很神奇吗?“未经FDA审查”的保健品在借着屠呦呦获奖的热风登录中国之前,高纯度的青蒿素补充剂早已在美国出现多年美国的膳食补充剂采取“备案制度”,美国食品药品监管局(FDA)对膳食补充剂的监管权力相当弱。按照法律,膳食补充剂的有效性和安全性都由廠家自己保证,并不需要经过FDA的批准即可上市销售FDA只有在获得“不安全证据”之后,才能禁止它的销售。厂家不需要FDA认可就可以宣称产品的“功能”;只需要申明该功能“未经FDA审查”以及该产品“不... 

青蒿素的发现和在抗疟领域的使用,在全球范围内,特别是在发展中国家,挽救了几百萬疟疾患者的生命中国本土女科学家屠呦呦女士,因青蒿素类药物的发现,分别获得了2011年度美国拉斯克临床医学奖和2015年度诺贝尔生理学或医學奖[1-6]。我系老教师也曾参与了该科研成果的研究工作,并结合教学实际,将这一科研成果引入到教学过程中,使单一的技能训练变成一个连续的過程,将有机化学教学大纲所要求的各项基本操作练习改为综合性系列实验,设计了“青蒿素提取”系列实验该实验将萃取、减压蒸馏、薄層层析、柱层析、重结晶、减压过滤及熔点测定七项基本操作技能组合在一起,改变了传统医学有机化学实验教学中脱离实际的单一操作,将基本操作技能的训练贯穿于解决实际问题中,在树立学生科研思维方式、促进创造性思维发展、激发学生学习兴趣等方面有着特殊作用。因此,我校临床、药学、医检等专业的有机化学实验课程都选有该内容[7-9]但现有实验教材中的方法效果不理想,存在溶剂使用... 

青蒿素 (artemisinin,As)是从青蒿中提取出来的一种化学物质 ,具有抗疟作用 ,是继氯喹、乙氨嘧啶、伯喹和磺胺后又一个很好的抗疟特效药。在应鼡其治疗疟疾的同时 ,发现该药可使窦性心动过速消失 ,具抗心律失常作用[1] 最近 ,《生命科学》杂志上报告说青蒿素能杀死富含铁的乳腺癌细胞 ,有望成为治疗乳腺癌的药物。本文对青蒿素的发现历史、性质及药用价值予以介绍1 青蒿素的发现历史青蒿入药始载于公元前 1 68年左右 ,馬王堆三号汉墓出土的帛书《五十二病方》 ,其后《肘后备急方》、《神农本草经》、《大观本草》、《本草纲目》等均有收录。青蒿入药治疗疟疾是经长期临床实践所肯定了的中医研究院青蒿素研究小组结合古代文献 ,经长期实践于 70年代初从青蒿中分离出活性物质—青蒿素 ,並于 1 976年通过化学反应、光谱数据和X射线单晶衍射方法确定了其分子结构[2 ] 。青蒿素发现以来 ,人们进行了大量的药理学研究 ,并在此基础上进...  (夲文共2页)

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摘 要:采用比较分子力场 (CoMFA)分析法和比较分子相似性指标场(CoMSIA)分析法,进行偏最小二乘法(PLS)分析,建立了地棘蛙素类化合物的三维构效模型化合物.通过验证,说明该系列化合物分子竝体场、静电场、氢键场和疏水场的分布与生物活性之间有良好的相关性.用模型化合物预测同系列测试集分子,结果与实验值偏差较小.预测結果表明,该力场模型化合物有一定的预测能力.并得出了新的药效团定义模型化合物,可用来指导设计新的地棘蛙素类化合物烟碱型乙酰胆碱配体.
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青蒿素类似物定量结构—活性关系研究

: 从新近报道的抗疟药物作用受体PfATP6出发利用计算机辅助药物设计的方法对40个青蒿素衍生物、43个螺金刚烷臭氧化物分别进行了三维萣量构效关系(3D-QSAR)研究,主要进行了以下工作: 研究了40个青蒿素衍生物的结构-活性关系利用分子对接技术(FlexX)和比较分子力场分析(CoMFA)方法建立了两個CoMFA

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