做细菌的基因敲除技术时目的基因的上下游基因与它交叉怎么办

基因敲除后的回补实验,如何确定基因的上游和下游的调节区? - 实验交流 - 生物秀
标题: 基因敲除后的回补实验,如何确定基因的上游和下游的调节区?
摘要: [基因敲除后的回补实验,如何确定基因的上游和下游的调节区?] 最近做了一个基因的敲除,可是在做回补的时候,不知道如何确定基因的上下游调节序列?看别人的文献,有的留2000bp,有的留1000bp,有哪位虫友做过相似的实验,请给我一些指点,非常感谢。基因序列,包括上下游在http:
ishare iask sina com cn f
htm 关键词:[基因 基因序列 序列 基因敲除 终止密码子]……
最近做了一个基因的敲除,可是在做回补的时候,不知道如何确定基因的上下游调节序列?看别人的文献,有的留2000bp,有的留1000bp,有哪位朋友做过相似的实验,请给我一些指点,非常感谢。
基因序列,包括上下游在http://ishare..cn/f/.html回复启动密码子和终止密码子上下游1kb就可以。回复不知道,高科技啊回复通常1K左右就够了,当然多点通常也没啥坏处,不过要是取太多,不小心把上下游的其它ORF也取进来了就不好了。回复不是很理解回补是什么意思,请教了。正在做干扰了,不过还没转化出来转化子了,暂时还检测不到。
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【求助】细菌的基因敲除怎么做?
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这个帖子发布于9年零28天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
最近想研究一个细菌的蛋白功能。看文献经常有基因敲除的菌株。不知道细菌的基因敲除怎么做?需要哪些质粒?请各位给些讲解或资料。谢谢。
不知道邀请谁?试试他们
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你应该到核酸技术中查查看。
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好的。谢谢。
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用自杀载体,通过同源重组, 把自杀载体插入你的目的基因,使该基因失活, 或者通过二次重组, 使目的基因的部分序列或者整个目的基因去掉. 如果需要相关资料,我可以介绍一些给你.
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细菌的基因敲除就是对目标基因的缺失.常应同源重组技术构建,最好从相关文献中查找.
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通过同源重组使特定靶基因失活,以研究该基因的功能,称为基因敲除(gene knock-out)基因敲除的技术路线如下:(1)构建重组基因载体﹔(2)用电穿孔等方法把重组DNA转入受体细胞内﹔(3)用选择培养基筛选已击中的细胞﹔(4)分子生物学检测。据俺所知目前有RecA重组系统、Red重组系统1、RecA重组系统由RecA和RecBCD组成,必须以环形的质粒状态存在。2、Red同源重组系统由λ噬菌体exo、bet、gam三个基因组成,线性载体即可。目前用这种方法敲除大肠杆菌的已经非常成熟了。也有很多人用基因沉默来研究细菌(例如antisense RNA)
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xuju2008 用自杀载体,通过同源重组, 把自杀载体插入你的目的基因,使该基因失活, 或者通过二次重组, 使目的基因的部分序列或者整个目的基因去掉. 如果需要相关资料,我可以介绍一些给你.您好,可否给予关于这方面的资料?万分感激~
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还有人做这块的人吗?我最近也想做。
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现在比较流行red重组
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xxll2006 现在比较流行red重组red只适合大肠杆菌吧?好像沙门也行,效率要低一些~~~其他的菌好像效率就非常低了吧?
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blowapc red只适合大肠杆菌吧?好像沙门也行,效率要低一些~~~其他的菌好像效率就非常低了吧?不止这两个
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xxll2006 不止这两个以前一个哥们不知道从哪个实验室顺了一套red的质粒,于是我想用red做弧菌,可能是我水平太差,做的一塌糊涂......现在重新开始用sacB 自杀质粒做了,虽然效率低,但是还是能做出来的。
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blowapc 以前一个哥们不知道从哪个实验室顺了一套red的质粒,于是我想用red做弧菌,可能是我水平太差,做的一 ...质粒是不是很麻烦?
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xxll2006 质粒是不是很麻烦?好久以前搞的,当时怎么做的几乎都忘了.......反正是没搞定~~~~Red现在又有新的进步了?
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blowapc 好久以前搞的,当时怎么做的几乎都忘了.......反正是没搞定~~~~Red现在又有新的进步了?我知道很多人用,不限于大肠,很多菌都有人做
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xxll2006 我知道很多人用,不限于大肠,很多菌都有人做筛选效率怎么样啊?用蔗糖自杀质粒,蔗糖的杀灭效率最多只有90%,最后筛选时太费劲了
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blowapc 筛选效率怎么样啊?用蔗糖自杀质粒,蔗糖的杀灭效率最多只有90%,最后筛选时太费劲了呵呵,不清楚
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xxll2006 呵呵,不清楚谢谢哈!我去查查相关文献再了解一下~~
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有人用cre/loxp系统敲除吗?
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我可以说我正在做吗?RecA重组系统和red系统都有用。。呵呵,不过没做出来还。
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我现在用的是cre-loxp系统的敲除,我想问一下各位如果敲的是它的必需基因,怎么办啊?设置对照?还是怎么的,不然没结果呢!
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zt滔滔江水 我可以说我正在做吗?RecA重组系统和red系统都有用。。呵呵,不过没做出来还。 red 怎么筛选重组质粒呀?
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用Kan把目的基因敲除了,该怎么把基因组上的Kan去除掉?
为了敲除目的基因,所以用长引物法把目的基因替换了,替换为kan,那么现在我该怎么样把KAn去除掉??能否做到无痕呢??有该方面的文献的请告诉我,谢谢大家:rol::rol::rol:
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