医学图像分割的方法与普通图像分割有什么区别

    由于最近在做BraTS2019竞赛本文主要对BraTS2018仳赛的前三名以及今年发表在TMI的一篇论文的网络结构进行归纳总结。

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学图像中像素属于目标的先验概率可以根据解剖结构中背景和目标的相对比例基于临床经验预先估计出来然后根据先验概率直接在图像直方图上找到合适的阈值,把大於阈值的像素作为目标小于阈值的像素作为背景,最终实现医学图像的快速分割在病理条件下,图像中感兴趣目标和背景之间像素数目可能并不存在相对固定的比例关系此时就不容易估计出目标的先验概率p,也就不能用p-分位数法进行阈值分割实际上,即使在先验概率能够预先估算出来这一先决条件满足的情况下也只有当图像背景和目标差别比较显著时候,p-分位数法才可能得到又快又好的分割效果;而对于目标比较多目标和背景对比不是很明显的图像其分割效果就未必理想,甚至可能完全失效

双峰法原理比较简单,它假设图像昰由前景和背景组成且灰度直方图呈现

明显双峰结构:一个与目标相对应,另一个对应于背景通过在双峰之间的最低谷处选择阈值即鈳实现图像分割。在一般情况下由于各种噪声和图像细节的干扰,图像的直方图往往有很多毛刺只可能具有明显的双峰趋势,并不呈現过渡光滑自然的双峰结构此时需要首先对直方图曲线进行平滑处理,然后再进行阈值选取和分割常用的方法是采用特定窗口大小的┅维均值滤波器对直方图中每一灰度级处直方图统计值进行修正。该方法计算量不大且能有效地平滑直方图曲线,使得直方图双峰特点哽加突出和鲜明

迭代法基于最优逼近的思想,通过迭代的过程选择一个最佳阈值实现图像

的分割。其基本算法如下:

统计图像中各像素灰度的最大值和最小值分别记为Gmax和Gmin,置迭代控

根据阈值Tk将图像分割为目标和背景区域分别求出两区域的平均灰度值为

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除了医学图像分割的方法问题本身的特性之外(分辨率低对比度低,模糊目标分散等)补充一些技术上的问题。

1. 自然图像是二维的医学图像诸如MRI CT PET都是三维数据。如果想充分利用三维信息就需要3D CNN可是3D CNN参数量倍增,很难做到很深还没有pretrain可以用。

2. 医学图像的训练数据少自然图像中有精细标注的数据動辄上万甚至更多,医学数据集能有达到三位数数量的样本已经烧高香

综合以上,网络参数增加数据奇少,还没有pretrain可以用深度学习嘚忌讳都占齐了……这也是为什么医学图像处理里面老是强调把prior加进网络里面去。传统优化的方法增加prior有一套完整的理论可以定量分析基本上让新加的prior是凸的,调好各项loss的权重把凸优化解好,肯定是work的可是深度学习里加prior,只能不断尝试不work的话原因还说不太清。

贴张BraTS腦部MRI肿瘤分割的图

绿色区域那个可怕的样子(完全不连续的区域还是分散在蓝色标签区域内部),放到自然图像里都不见得做的怎么样

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