已知向量序列一蛋白编码基因的序列,请问可采用怎样的方法分析,推测其功能

2007年我国科学家率先完成了家蚕基因组精细图谱的绘制,将13000多个基因定位于家蚕染色体DNA上.请回答以下有关家蚕遗传变异的问题:(l)在家蚕的基因工程实验中,分离基因的做法包括用对DNA进行切割然后将DNA片段与结合成重组DNA,再将重组DNA转入大肠杆菌进行扩增等.(2)家蚕的体细胞共有56条染色体,对家蚕基因组进行分析(参照人类基因组计划要求),应测定家蚕条双链DNA分子的核苷酸序列.(3)决定家蚕丝心蛋白H链的基因编码区有16000个碱基对,其中有1000个碱基对的序列不编码蛋白质,该序列叫;剩下的序列最多能编码个氨基酸(不考虑终止密码子),该序列叫.(4)为了提高蚕丝的产量和品质,可以通过家蚕遗传物质改变引起变异和进一步的选育来完成.这些变异的来源有:.(5)在家蚕遗传中,黑色(B)与淡赤色(b)是有关蚁蚕(刚孵化的蚕)体色的相对性状,黄茧(D)与白茧(d)是有关茧色的相对性状,假设这两对性状自由组合,杂交后得到的子代数量比如下表:亲本子代黑蚁黄茧黑蚁白茧淡赤蚁黄茧淡赤蚁白茧组合一9331组合二0101组合三3010①请写出各组合中亲本可能的基因型组合一组合二组合三②让组合一杂交子代中的黑蚁白茧类型自由交配,其后代中黑蚁白茧的概率是()。-乐乐题库
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2007年我国科学家率先完成了家蚕基因组精细图谱的绘制,将13000多个基因定位于家蚕染色体DNA上.请回答以下有关家蚕遗传变异的问题:(l)在家蚕的基因工程实验中,分离基因的做法包括用对DNA进行切割然后将DNA片段与结合成重组DNA,再将重组DNA转入大肠杆菌进行扩增等.(2)家蚕的体细胞共有56条染色体,对家蚕基因组进行分析(参照人类基因组计划要求),应测定家蚕条双链DNA分子的核苷酸序列.(3)决定家蚕丝心蛋白H链的基因编码区有16000个碱基对,其中有1000个碱基对的序列不编码蛋白质,该序列叫;剩下的序列最多能编码个氨基酸(不考虑终止密码子),该序列叫.(4)为了提高蚕丝的产量和品质,可以通过家蚕遗传物质改变引起变异和进一步的选育来完成.这些变异的来源有:.(5)在家蚕遗传中,黑色(B)与淡赤色(b)是有关蚁蚕(刚孵化的蚕)体色的相对性状,黄茧(D)与白茧(d)是有关茧色的相对性状,假设这两对性状自由组合,杂交后得到的子代数量比如下表:亲本子代黑蚁黄茧黑蚁白茧淡赤蚁黄茧淡赤蚁白茧组合一9331组合二0101组合三3010①请写出各组合中亲本可能的基因型组合一组合二组合三②让组合一杂交子代中的黑蚁白茧类型自由交配,其后代中黑蚁白茧的概率是()。限制酶(或限制性内切酶)运载体(或质粒)&&(2)29&
本题难度:一般
题型:解答题&|&来源:2009-生物的变异
分析与解答
习题“2007年我国科学家率先完成了家蚕基因组精细图谱的绘制,将13000多个基因定位于家蚕染色体DNA上.请回答以下有关家蚕遗传变异的问题:(l)在家蚕的基因工程实验中,分离基因的做法包括用对DNA进行切割然后将D...”的分析与解答如下所示:
考查了基因工程、遗传变异的相关内容。通过基因工程获得目的基因的途径有:鸟枪法、反转录法和人工合成法。最简单的方式是用限制酶对DNA进行切割获得目的基因。将获得的DNA片段与载体结合,得到重组DNA后,再导入受体细胞。家蚕是ZW性别决定,含有Z、W两条性染色体,所以在对家蚕基因组进行分析时应分析27条常染色体核2条性染色体(Z、W染色体)。家蚕的基因分为编码区和非编码区,编码区又有内含子和外显子之分,其中外显子能编码氨基酸,由此可知丝心蛋白H链的基因编码区有16000个碱基对,其中有1000个碱基对的序列不编码蛋白质,能编码氨基酸的个数为()/3=5000个。对家蚕而言可遗传的变异来源有三个:基因突变、基因重组和染色体变异。组合一:根据后代性状比为黑蚁:淡赤蚁=3:1;黄茧:白茧=3:1,说明了双亲控制两对相对性状的基因组合均为杂合体,即双亲组合基因型BbDd(或BbDd×BbDd)。组合二:根据后代性状比为黑蚁:淡赤蚁=1:1;后代只有白茧一种性状,说明了双亲控制体色基因组合是Bb、bb,而茧色只有一种基因组合:dd,即双亲组合基因型BBdd、bbdd(或BBdd×bbdd)。组合三:根据后代性状比为黑蚁:淡赤蚁=3:1,说明了双亲控制体色基因组合均是Bb;而茧色全为黄色说明了双亲之一必为纯合体DD,由此可推知双亲的基因组合为BbDD、BbDd、Bbdd(或BbDD×BbDD、BbDd×BbDD、BbDD×Bbdd)。组合一中黑蚁白茧的基因型为BBdd和Bbdd,其中前者占1/3,后者占2/3。它们自由交配随即组合:BBdd×BBdd、2(BBdd×Bbdd)、Bbdd×Bbdd将这三种组合产生黑蚁白茧的概率相加即可。或得出淡赤蚁出现的概率,也可得黑蚁白茧的概率。
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2007年我国科学家率先完成了家蚕基因组精细图谱的绘制,将13000多个基因定位于家蚕染色体DNA上.请回答以下有关家蚕遗传变异的问题:(l)在家蚕的基因工程实验中,分离基因的做法包括用对DNA进行切...
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等考点的理解。
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染色体变异与育种
与“2007年我国科学家率先完成了家蚕基因组精细图谱的绘制,将13000多个基因定位于家蚕染色体DNA上.请回答以下有关家蚕遗传变异的问题:(l)在家蚕的基因工程实验中,分离基因的做法包括用对DNA进行切割然后将D...”相似的题目:
下图是用某种作物的两个品种①和②分别培育出④、⑤、⑥品种的示意图,试分析回答:(1)、用①和②培育⑤所采用的D和F步骤分别是&&&&和&&&&&。其应用的遗传学原理是&&&&。(2)、用③培育⑤所采用的E和H步骤分别是&&&&&和&&&&。其应用的遗传学原理是&&&&。&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&
关于染色体组、单倍体、二倍体和多倍体的叙述中,不正确的是&&&&一个染色体组中不含同源染色体由受精卵发育的个体,体细胞含有两个染色体组的叫二倍体含有一个染色体组的个体是单倍体,单倍体不一定含有一个染色体组人工诱导多倍体唯一的方法是用低温处理萌发的种子或幼苗
下列关于育种优点的叙述,不正确的是&&&&多倍体较二倍体茎杆粗大,果实种子大杂交育种能产生新基因人工诱变育种能提高变异频率利用单倍体育种能明显缩短育种年限
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(12分)真核细胞的基因由编码区和非编码区两部分组成(如下图一示),其中编码区包括能够编码蛋白质的序列(外显子)和一般不能够编码蛋白质的序列(内含子)。在真核细胞基因表达时,首先由DNA转录出前驱mRNA,然后经过裁接(将内含子的转录部分切除并将外显子的转录部分连接起来)才能形成成熟的mRNA。但在裁接时有可能会发生选择性裁接(在裁接时可能会同时切除某一个或几个外显子的转录部分,即形成不同的裁接形式)和RNA编辑(将前驱mRNA上的核苷酸序列加以修改,包括碱基置换或碱基增减)。选择性裁接和RNA编辑的存在,进一步增加了蛋白质结构和功能的多样性。请分析回答(1)写出遗传信息的传递和表达过程图式:&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&。(2)由于DNA分子的双链靠碱基之间的的氢键相结合,因而增强了DNA分子结构的稳定性。下列双链DNA结构在复制时,最不容易解旋的是(  )  A、&&&&&& B、C、(3)选择性裁接和RNA编辑作用发生在细胞中的          (部位)。(4)人的apoB基因在肝细胞中表达出apoB-100蛋白质(数字表示该蛋白质含有的氨基酸数),但是在小肠细胞中, apoBmRNA上靠近中间位置的某一个“-CAA”密码子上的“C”被编辑为“U”,因此只能表达出apoB-50蛋白质。则下列有关分析中正确的是(  )(不定项选择)A、apoB基因含有606个脱氧核苷酸;B、apoB基因在肝细胞中转录的mRNA长度约是小肠细胞中转录的mRNA长度的2倍;C、apoB-100蛋白质和apoB-50蛋白质有50个氨基酸完全一样;D、apoB-100蛋白质和apoB-50蛋白质都是apoB基因的表达产物;E、apoB-50蛋白质的产生是因为apoB基因在转录时发生选择性裁接的结果。 (5)科学家将人的生长激素基因导入大肠杆菌以获取人生长激素(如图二)。已知限制酶I的识别序列和切点是—G↓GATCC— ,限制酶II的识别序列和切点是—↓GATC—。①目的基因可以通过&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&方法获取。②重组质粒构建过程中需要用到的酶包括限制性内切酶和&&&&&&&&&&&&&&&&&酶。在DNA双链上,被限制性内切酶特异性识别(酶切位点处)的碱基序列特点是     &&&                      。③据图分析,在构建基因表达载体过程中,应选用&&&&&&&&(限制酶I / 限制酶II)切割质粒,选择理由是                         。④成功导入该重组质粒的细菌能否生长在含四环素的培养基上?    ;能否生长在含抗氨苄青霉素素的培养基上?      ;根据此原理可完成转基因工程的筛选(工程菌)环节。(6)如果某基因中的一个碱基发生突变,则突变基因控制合成的蛋白质与正常蛋白(正常基因控制合成)相比是否一定不同,并说明理由?&&&&&&&&&&&&&&&&&&&        。&&&&&&&                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
(12分)真核细胞的基因由编码区和非编码区两部分组成(如下图一示),其中编码区包括能够编码蛋白质的序列(外显子)和一般不能够编码蛋白质的序列(内含子)。在真核细胞基因表达时,首先由DNA转录出前驱mRNA,然后经过裁接(将内含子的转录部分切除并将外显子的转录部分连接起来)才能形成成熟的mRNA。但在裁接时有可能会发生选择性裁接(在裁接时可能会同时切除某一个或几个外显子的转录部分,即形成不同的裁接形式)和RNA编辑(将前驱mRNA上的核苷酸序列加以修改,包括碱基置换或碱基增减)。选择性裁接和RNA编辑的存在,进一步增加了蛋白质结构和功能的多样性。请分析回答(1)写出遗传信息的传递和表达过程图式:&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&。(2)由于DNA分子的双链靠碱基之间的的氢键相结合,因而增强了DNA分子结构的稳定性。下列双链DNA结构在复制时,最不容易解旋的是(  )  A、&&&&&& B、C、(3)选择性裁接和RNA编辑作用发生在细胞中的          (部位)。(4)人的apoB基因在肝细胞中表达出apoB-100蛋白质(数字表示该蛋白质含有的氨基酸数),但是在小肠细胞中, apoBmRNA上靠近中间位置的某一个“-CAA”密码子上的“C”被编辑为“U”,因此只能表达出apoB-50蛋白质。则下列有关分析中正确的是(  )(不定项选择)A、apoB基因含有606个脱氧核苷酸;B、apoB基因在肝细胞中转录的mRNA长度约是小肠细胞中转录的mRNA长度的2倍;C、apoB-100蛋白质和apoB-50蛋白质有50个氨基酸完全一样;D、apoB-100蛋白质和apoB-50蛋白质都是apoB基因的表达产物;E、apoB-50蛋白质的产生是因为apoB基因在转录时发生选择性裁接的结果。 (5)科学家将人的生长激素基因导入大肠杆菌以获取人生长激素(如图二)。已知限制酶I的识别序列和切点是—G↓GATCC— ,限制酶II的识别序列和切点是—↓GATC—。①目的基因可以通过&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&方法获取。②重组质粒构建过程中需要用到的酶包括限制性内切酶和&&&&&&&&&&&&&&&&&酶。在DNA双链上,被限制性内切酶特异性识别(酶切位点处)的碱基序列特点是     &&&                      。③据图分析,在构建基因表达载体过程中,应选用&&&&&&&&(限制酶I / 限制酶II)切割质粒,选择理由是                         。④成功导入该重组质粒的细菌能否生长在含四环素的培养基上?    ;能否生长在含抗氨苄青霉素素的培养基上?      ;根据此原理可完成转基因工程的筛选(工程菌)环节。(6)如果某基因中的一个碱基发生突变,则突变基因控制合成的蛋白质与正常蛋白(正常基因控制合成)相比是否一定不同,并说明理由?&&&&&&&&&&&&&&&&&&&        。&&&&&&&                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
在一个典型真核细胞的基因中,能够编码蛋白质的是(&&&
C.非编码区&& 查看话题
已知蛋白质38KD,如何获得其全长基因序列?
血栓栓塞性疾病严重影响人类的健康和寿命。由血栓引起的常见疾病主要有急性心肌梗塞、脑血栓和静脉血栓塞等。目前,临床上治疗血栓栓塞性疾病的首选方法是溶栓疗法,此法具有死亡率低、费用少等优点,更适合我国国情。因此近年来人们一直热衷于研究开发新的经济、适用、有效、无毒副作用的溶栓药物。我们最近从豆豉中筛选到一株能分泌高效水解血纤维蛋白(血栓的主要成分)的酶的芽孢杆菌菌株,经SDS-PAGE鉴定,该溶栓酶的分子量约38 kD 。但至今还没有见到该菌产溶栓酶的报道,也没有该酶基因的任何资料,请详细设计一株能高产分泌型溶栓酶的基因工程菌的构建路线,内容包括目的基因的克隆、重组、表达。
先把蛋白质的氨基酸序列转变为核苷酸序列,然后:
5’-RACE,基因组文库筛选出完整基因,反向PCR,染色体步移等即可获得全基因序列。具体文献和Procotols,查分子克隆。
Molecular cloning--Laboratory manuals(2001)3rd edition(3 Volumes) Free
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=5998393
获得全序列基因之后,就构建载体,对构建的载体进行检测以确保载体构建成功(可以电泳或者直接测序),导入工程细胞(电转化,氯化钙等),诱导载体上的目的基因表达,筛选表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),大规模培养表达目的基因的工程细胞(阳性克隆),最后粉碎细胞或者分离分泌表达产物,复性和分离目的蛋白质,质检,临床前试验,临床1-3期实验。
具体文献和Procotols,查阅有关基因工程的实验手册。 把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE. : Originally posted by bullfrog325 at
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE. 挖出来的这一条 要是 不能 保证 是纯的一个蛋白&&做质谱 能得到 氨基酸信息吗? 没有关系, 因为你已经看到单一的条带了, 就算样品里面有其他的蛋白污染也是含量很少的。 你可以从质谱峰的丰度里面判断出那些峰是属于你真正想要鉴定的蛋白。 : Originally posted by 凌波丽 at
先把蛋白质的氨基酸序列转变为核苷酸序列,然后:
5’-RACE,基因组文库筛选出完整基因,反向PCR,染色体步移等即可获得全基因序列。具体文献和Procotols,查分子克隆。
Molecular cloning--Laboratory manu ... 就只知道是个蛋白,也可以把该蛋白拿去测氨基酸序列吗? : Originally posted by bullfrog325 at
把那个38kDa的蛋白从胶上挖出来送质谱测序, 这样你会得到一部分氨基酸序列的信息. 然后参考一楼的答复, 根据这些蛋白片段序列设计引物做5' 和 3' RACE. 正解!得到的氨基酸序列的信息设计兼并引物可以先扩增基因片段,根据得到的片段设计race引物得到全长。一般sds-page条带shot gun应该可以得到目的序列,如得不到信息可进一步做2d分离后做质谱 : Originally posted by OBM2013 at
就只知道是个蛋白,也可以把该蛋白拿去测氨基酸序列吗?... 我真的不明白你在说什么?!蛋白质可以用edaman降解法为基础的自动测序仪测序,也可以MS-MS测序(后者必须将蛋白质水解为18-25aa redues)的多肽,并且要用两种裂解方法,形成重叠肽)-----MS-MS测序费用太高,一般只测定N-末端16-20aa redues,然后到蛋白质数据库中搜索出全序列,再根据全序列的5’基因来RACE。任何新蛋白质连序列不知道的话,能够被承认吗!? 蛋白质可以用Edman降解法为基础的自动测序仪测序,也可以MS-MS测序(后者必须将蛋白质水解为18-25aa redues)的多肽,并且要用两种裂解方法,形成重叠肽)-----MS-MS测序费用太高,一般只测定N-末端16-20aa redues,然后到蛋白质数据库中搜索出全序列,再根据全序列的5’基因来RACE。
任何新蛋白质连序列不知道的话,能够被承认吗!?
楼主已经做了SDS-PAGE,那就是蛋白质样品已经得到,并且能够从凝胶上会收到38kd,得到了蛋白质还不能送到有关生物技术公司测序-----------用Edman降解法为基础的自动测序仪测序在价格上能够承受。如果不是有钱太多而且基于花掉,MS-MS测序(后者必须将蛋白质水解为18-25aa redues)的多肽,并且要用两种裂解方法,形成重叠肽)还算了吧。
我就不知道OBM2013在说什么!!?? 如果质谱对分子量是38 KD的全新的蛋白质(数据库里没有该蛋白质的一级结构)进行从头测序,一个氨基酸残基的分子量110,38 KD蛋白质有300+个氨基酸残基,串联质谱一次一般只能测定大约18-25个氨基酸残基的序列,至少要用两种方法裂解38 KD蛋白质,也就是串联质谱600+个氨基酸残基的蛋白质进行从头测序(断裂成为大约18-25个氨基酸残基的片段,可以有修饰成分,分别从头测序)。。。呵呵。。。估计是太有钱了。。。
串联质谱测多肽序列是用于在数据库中搜索的,还有测定修饰成分的。一般而言,质谱是测定蛋白质有限水解后的多肽的序列的,然后根据此多肽的序列道蛋白质数据库中去搜索到对应的蛋白质的信息。
一般的,如果蛋白质修饰成分比较多,可以事先测定蛋白质组成成分和用软件预测可能的修饰位点,在对蛋白质有限水解,对蛋白质修饰成分可能比较多的未知蛋白质用串联质谱从头测序,其他部分还是先用Edman降解的自动测序仪测序。
当然自己有质谱仪例外。 顺便说一句:用阶梯法测定蛋白质或者多肽的序列,是结合质谱和Edaman降解的测序方法,其费用也不低。
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求助各位虫虫,有没有人知道如何从蛋白质氨基酸序列来推测基因序列的研究手段
RT,通过分离得到的蛋白,如何能得到编码其的基因序列?PS,该物种全基因组已经测序。
各位虫虫不吝赐教!!!!!!!!!!!
建议楼主BLAST,将蛋白质的氨基酸序列,直接转换成对应的可能的核酸序列。在NCBI网站就可以。或者百度Blast,有详细的操作方法。另外,,你那个不是基因序列已经都测定了吗?用个翻译软件,翻译一下,将所得的氨基酸序列与你的序列比对下就可以了吧。希望可以帮到你。 去NCBI用tblastn, http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=tblastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome, 可以选择你所用的species来限定结果 : Originally posted by wizardfan at
去NCBI用tblastn, http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=tblastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome, 可以选择你所用的species来限定结果 首先非常感谢你的回答,然后我想请教一下,N端测序测序能够像核酸测序一样,知晓每条多肽链的氨基酸组成,然后,tblastn的准确性又有多高? 1. 分离得到的蛋白如果不知道其序列,需要先测定起序列
2. 把你的蛋白进行Blast,获得其他物种的同源蛋白,并对这些蛋白进行比对
3. 找出蛋白的进化保守序列,设计兼并引物
4. 运用兼并引物在你的物种中扩增其编码基因序列 :hand::hand: : Originally posted by 樱花有泪 at
首先非常感谢你的回答,然后我想请教一下,N端测序测序能够像核酸测序一样,知晓每条多肽链的氨基酸组成,然后,tblastn的准确性又有多高?... tblastn的准确度和其他BLAST程序是一样的。
不懂你说的“N端测序测序”,我就知道通过质谱可以做de novo,但是这个准确度不是太高,比如无法区分I和L 请参阅Cui et al. MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT 71:19–28 (2005)。是你想要的!!
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