如何用MEGA构建系统进化树的构建

如何用MEGA5.0以及Clustalx1.83构建进化树_百度文库
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如何用MEGA5.0以及Clustalx1.83构建进化树|
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如何使用mega 5.0做进化树,要急用,但身边没人会,跪求
如何使用mega 5.0做进化树,要急用,但身边没人会,跪求
网上有很多资源,搜一下就能找到。你用哪部分就去学那部分,没有那么难。 : Originally posted by yuren2009 at
网上有很多资源,搜一下就能找到。你用哪部分就去学那部分,没有那么难。 谢谢,我看看 http://emuch.net/html/0906.html (如何用MEGA5.0和Clustalx1.83构建进化树)
这个帖子上有使用说明 /view/1d54cfb770b5683.html?qq-pf-to=pcqq.temporaryc2c看看这个,只用MEGA5做进化树,我用的还是4呢,做出来的也不错 请看/s/1hqgeu9m;我用过的,很好哦。
var cpro_id = 'u1216994';
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&&& &为了解决用户可能碰到关于"为什么Blast比对得到的相似度与MEGA3.1软件构建序列进化树之后得到的相似度不同?"相关的问题,突袭网经过收集整理为用户提供相关的解决办法,请注意,解决办法仅供参考,不代表本网同意其意见,如有任何问题请与本网联系。"为什么Blast比对得到的相似度与MEGA3.1软件构建序列进化树之后得到的相似度不同?"相关的详细问题如下:相似度为97%,是因为这个造成的吗.两者比对原理是什么,但构建进化树时得到将近99%比如序列进行Blast比对之后===========突袭网收集的解决方案如下===========
解决方案1:如果你经过blast的比对和你做进化树所需要得到的结果是一样的,那就没有必要看是什么原因造成的了
================可能对您有帮助================
答:主要是看后面的相似度,Query coverage 值,用百分之几来表示的,百分数越高,表示相似度越高,还有一个是E value ,这个值越小的话表示相似度越高。===========================================问:比如序列进行Blast比对之后,相似度为97%,但构建进化树时得到将近99%...答:如果你经过blast的比对和你做进化树所需要得到的结果是一样的,那就没有必要看是什么原因造成的了===========================================问:比如序列进行Blast比对之后,相似度为97%,但构建进化树时得到将近99%...答:通过鉴定同源性,进行功能的预测等===========================================问:比如序列进行Blast比对之后,相似度为97%,但构建进化树时得到将近99%...答:为什么blast序列比对相似度100%,用MEGA5做进化树相似度最大的60?
22:10 匿名 | 分类:生物学 我要回答 分享到: ...===========================================问:比如序列进行Blast比对之后,相似度为97%,但构建进化树时得到将近99%...答:怎么用在blast上比对序列的相似度和同源性?不知道...21 21:04 | 提问者:ldh2018 | 问题为何被关闭 ...来获取免费代码吧! 如要投诉或提出意见建议,请到...===========================================问:比如序列进行Blast比对之后,相似度为97%,但构建进化树时得到将近99%...答:什么叫相似率 特异性太低了吧 换一对呗===========================================问:有谁会用BLAST软件,本地版。。。序列比对软件,急求挨······答:blast你是不会命令还是怎么? 1.首先要把被对比的序列做成数据库 makeblastdb -in D:\blast\db\source\db.fasta -dbtype nucl -out D:\blast\db\source\db 其中D:\blast\db\source\db.fasta 是做成数据库文件的路径,D:\blast\db\source\db 是输...===========================================问:我想知道怎么用blast确定我测定的序列是不是ANME菌,在blast上怎么操作...答:把你的序列粘进去blast,出现的结果列表里面去找所谓的“ANME菌”。结果中如果这个序列跟A菌的序列的相似度很高,那你的序列就很可能是这个菌了。 (这个blast的过程就是你的序列和所有序列比较的过程,当然包括A) 如果确实要做两两比较,那你把A...===========================================问:我有一段序列,在NCBI上比对之后,找到一段相似度99%的序列,然后手动将...答:你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。===========================================用MEGA构建进化树_百度文库
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就是用MEGA生成进化树后,进化树下面的标尺表示什么意思的?他的单位是什么呢?还有根据进化树采用的方法会得到不同的标尺,这些都是什么含义呢?我认为这是MEGA构建进化树最难理解的问题,我不是学习生物信息专业的,希望有能够知道这方面知识的人告诉我哈。谢谢
好像是百万年,不过应该也得看设置具体算法还是得问学这方面的人
请贴图,树有两种,一种距离无意义,一种距离代表基因差异大小      ----小时候我的理想是长大了做个有钱人,现在我的理想实现了一半。   
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