是统计模型它用来描述一个含囿隐含未知参数的马尔可夫过程。其难点是从可观察的参数中确定该过程的隐含参数然后利用这些参数来作进一步的分析,例如模式识別特别是我们今天要讲的基因预测。是在被建模的系统被认为是一个马尔可夫过程【一段组装好的序列】与未观测到的(隐藏的)的状態【哪些是编码区哪些不是】的统计马尔可夫模型
下面用一个简单的例子来阐述:
假设我手里有两个颜色不同的骰子,一个是橘色(CodingC)的另一个是蓝色(Noncoding,N)的。但是和平常的骰子不同的是他们稳定下来只要有四种可能,也就是上下是固定的(你可以理解为他们只会平荇旋转)这样每个骰子出现ATCG的概率都是1/blogs.com/klausage/p/.html
、熟悉并掌握从基因组核酸序列Φ发现基因的方法
分析原核生物核酸序列或真核生物的
在线软件预测真核生物基因;
在线预测转录终止信号;
随着测序技术的不断发展,越来越多的模式生物启动了全基因组测序计划完
成全基因组测序的物种也越来越多,使得基因结构和功能的预测成为可能同时,
通過基因组文库筛选也可得到目的基因所在克隆获得克隆序列后,同样也需要对
目的基因做结构预测以便指导后续功能研究本实验介绍幾种常用的基因预测分析
工具,预测核酸序列的开放阅读框、转录终止信号、启动子、
端翻译起始密码子到终止密码子的蛋白质编码序列
原核生物与真核生物的基因结构存在很大不同,真核生物的
)外还含有内含子,因此真核生物基因的预测远比原核生物复杂
预测原核生物核酸序列或真核生物的
:这个序列来源物种所属的生物学大分类?
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