根据我看到的信息转述一下可能的原因：

1、全部下船情况下，所有感染人数将计算在日本头上严重影响世界对日本疫情的判断，日本害怕戴上“病毒感染国”的帽子产生对于日本经济等各方面不利影响（参考世界部分国家对中国禁飞的举措）。特别是今年东京将举行奥运会不能有失。

补充：为筹備东京奥运会日本预计总投入将达1500亿人民币上下（有报道称250亿美元）

2、邮轮不属于日本，该责任日本不认为需要自己承担j（日本之所鉯让其停靠有4个原因。一、人道主义援助；二、邮轮所有权不属于日本但是是由日本制造；三、该船是首艘以日本港口为母港的豪华游輪，对旅游业意义重大；四、船上日本游客较多）

3、一次性隔离如此巨大人数并对各人进行病毒检测，将耗费巨大人力、物力、财力

4、转移、隔离过程给病毒传染带来更多机会，增加更多病例使病毒在日本本土传染开来。