如何解读GRCh38/hg38 2q31.1-33.2(chr2:174898848-203941548)x1

点击联系发帖人 时间：2020-02-09 22:01
hg是谁 

  

  

    56655个gene name（为什么有将近两千个是重复）
  

  

    1. 为什么用gencode的注释文件做表达定量会出问题
  

  

    2. 不同的release之间有什么区别？
  

  

    3. 不同来源的注释区别在哪里
  


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          2018年06月30 - 作业要求： 在UCSC下载19参考基因組我博客有详细说明，从gencode数据库下载基因注释文件并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构，比如TP53,KRAS,EGFR等等 作业，截图几个基因的IGV可视化结構！还可以下载ENSEMBLNCBI的gtf，也导入IGV看看截图基因结构。
        

        

          

        

      

    

    

      

        

          

        

      

    

    

      

        

          

        

      

    

    

      

        

          2017年06月06 - 　　GTF文件的全称是gene transfer format主要是对染色体上的基因进行标注。怎么理解呢其实所谓嘚基因名，基因座等都只是后来人们给一段DNA序列起的名字而已，还原到细胞中就是细胞核里面的一条长长的染色体（DNA序列）而这个GTF文件的主要功能，就是指出我们所谓的基因在染色体上
        

        

          

        

      

    

    

      

        

          

        

      

    

    

      

        

          

        

      

    

    

      

        

          2016年09月30 - ??N年前测序还是问题基因组的解读排在后边，现如今测序已然不是问题， 荿百上千的基因组被测序这么多的基因组需要解读还真不是件容易的事。以前高大上的工作注定要飞入寻常百姓家。开发出易用且准確度高的注释工具就很迫切了 ??首先来说说编码蛋白基因的注释。真核生物的基因往往具有内含子不像
        

        

          

        

      

    

    

      

        

          2017年01月09 - 这是我们论坛上的一个題目：生信编程直播第一题：人类基因组的外显子区域到底有多... 外显子组的序列仅占全基因组序列的1%左右，但大多数与疾病相关的变异位於外显子区通过外显子组测序可鉴定约8万个变异，全基因组测序可鉴定300万个变异因此与全基因组测序相比，外显子组测序不仅费用较低数据阐释也更为
        

        

          

        

      

    

  



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