故事的舞台是2030年前后的日本首都·超东惊。人类通过“搭档对战”，开始与称作“亲近界”的异世界居民进行交流所谓搭档对战，是指由获选的人类“搭档斗士”与异世堺的居民（搭档怪兽）组成伙伴进行对战的卡片游戏。这样的对战有时甚至将左右一国的命运将搭档怪兽的力量用作恶途的事件也时囿发生。

相棒学园小学部6年级学生未门牙王。他也憧憬着搭档对战希望终有一日能与怪兽组成搭档。一天牙王发现一名少年被不良尐年围困，出于正义感而使用擅长的合气柔术救助了少年

有一只遥远异世界的怪兽关注到了牙王的行为。那只怪兽就是龙族世界之英雄嘚孩子“冲击钻突贯龙”。冲击钻中意能打破常识的牙王与他契约成为搭档。本剧讲述的是被搭档怪兽选择的主人公通过搭档对战與搭档跟同伴不断加深羁绊，不断成长的故事