【摘要】:为了研究CTNNBIP1和ICMT基因共表達在膀胱尿路上皮癌中的作用及对患者预后的诊断价值,本研究选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中412例膀胱尿路上皮癌数据资料,利用cBioPortal数据库对膀胱尿路上皮癌CTNNBIP1基因、ICMT基因及其共表达基因作生存分析,将Pearson和Spearman相关系数均大于0.3的基因定义为中等程度以上共表达相关的基因通过String数据库获取这些基因共表达的互作关系组。采用DAVID数据库、GO数据库、KEGG数据库分别对其进行信号通路和功能分析,生物学过程聚类分析,信号通路聚类分析结果显示:TCGA数据库中的膀胱尿路上皮癌患者CTNNBIP1和ICMT存在共表达(Pearson相关系数=0.46和Spearman相关系数=0.47)。String数据库显示基因共表达有38组具有互作关系KEGG数据库显示CTNNBIP1-ICMT基因共表达所富集的信号通路集中在细胞周期(p0.05)。DAVID数据库分析其功能主要为调节细胞生长和有丝分裂、负性调控Wnt信号通路、蛋白激酶结合等生存汾析证实CTNNBIPI1和ICMT基因共表达与患者总生存率显著相关(p=0.002
72),CTNNBIPI1和ICMT共表达阳性患者的预后最差。由此得出结论:CTNNBIP1和ICMT在膀胱尿路上皮癌中存在共表达,对CTNNBIP1-ICMT基因共表达网络和生物信息学分析,可找到其在膀胱尿路上皮癌中的作用及信号通路,为深入研究膀胱尿路上皮癌的发病机制提供了理论基础,可提高膀胱尿路上皮癌患者的预后
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张萌;伍季;夏中友;李云祥;范俊;;[J];西部医学;2017年02期
|
冯留伟;李铁强;侯俊清;;[J];中国医药生物技術;2014年01期
|
杨铁军;赵世明;马永康;唐献策;陈小兵;何朝宏;;[J];肿瘤基础与临床;2017年02期
|
王国伟;朱新华;陈华;;[J];中外医学研究;2016年04期
|
钟晓健;黄洪才;叶东明;韩跃辅;方海林;彭潋;陈清江;潘斌;;[J];山东医药;2016年39期
|
|
|
宗华凤;温爽;盖宇;刘天卿;;[J];诊断病理学杂志;2014年09期
|
肖兰;杨继洲;康照利;;[J];肿瘤防治研究;2011年03期
|
颜汝平;王剑松;李翀;左毅刚;柯昌兴;詹辉;王伟;;[J];中国全科医学;2011年09期
|
|
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|
肖四方;张应爱;肖敬川;曹卉;张淑芳;;[A];第一次全国中西医结合检验医学学术会议暨中国中西医结合学会检验医学专业委员会成立大会论文汇编[C];2014年
|
高用军;王成跃;;[A];2013年贵州省泌尿外科学术会议论文汇编[C];2013年
|
肖日海;伍耿青;王晓宁;江波;薛义军;邹晓峰;张国玺;袁源湖;孙志熙;;[A];华东六省一市泌尿外科学术年会暨2011年浙江省泌尿外科、男科学学术年会论文汇编[C];2011年
|
李锋;王成跃;吴志岼;高用军;樊国军;刘波;;[A];2013年贵州省泌尿外科学术会议论文汇编[C];2013年
|
陈允松;章宜芬;;[A];中华医学会病理学分会2010年学术年会日程及论文汇编[C];2010年
|
梁军号;齐隽;陳建华;张良;王伟民;刘建河;白强;康健;沈海波;盛旭俊;虞永江;;[A];第十五届全国泌尿外科学术会议论文集[C];2008年
|
李法锦;王明丽;;[A];贵州省预防医学会2014年学术年會暨传染病预防控制与公共卫生人才培养论坛论文集[C];2014年
|
邱晓拂;胡卫列;王元利;王尉;沈文;张长征;;[A];第七次中国中西医结合泌尿外科学术年会暨第②次广东省中西医结合泌尿外科学术年会论文集[C];2009年
|
叶锦;靳风烁;王鹏;;[A];第十六届全国泌尿外科学术会议论文集[C];2009年
|
孙庭;谢文杰;梅金红;王共先;崔苏萍;马明;;[A];华东六省一市泌尿外科学术年会暨2011年浙江省泌尿外科、男科学学术年会论文汇编[C];2011年
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}