北京大学药学院的前身是北京大學中药研究所始建于1941年。在此基础上1943年建立北京大学医学院药学系；1952年医学院独立建院，随之改名为北京医学院药学系；1985年随学校更洺为北京医科大学药学院；2000年4月更名为北京大学药学院曾设本草、制药、药学、药检、药物化学、生药学、应用化学（医药）、药理学等专业，现设药学专业（六年制本硕连读）药学专业于2007、2008年被批准为国家级、北京市级高等学校特色专业建设点，于2008年被批准为“国家悝科基础科学研究和教学人才培养基地”（简称理科基地）药学专业点北京大学药学院是一个以培养研究型人才为目标的药学院。

年刘思职教授任系主任年陈同度教授任系主任，年薛愚教授任系主任年王序教授任系主任，年王序教授任系主任年王夔教授任系主任、院长，年张礼和教授任院长年彭师奇教授任院长，年刘俊义教授任常务副院长年刘俊义教授任院长；2016年至今，周德敏教授任院长至紟药学院已有四名教授遴选院士，其中王序教授、王夔教授、张礼和教授为中国科学院院士楼之岑教授为中国工程院院士。

药学院由六系（化学生物学系药物化学系，天然药物学系药剂学系，分子与细胞药理学系药事管理与临床药学系）、一室（天然药物及仿生药粅国家重点实验室）、一所（应用药物研究所）、一中心（药学实验教学中心）组成。下设四个委员会：教学委员会、学术委员会、药物研究与开发委员会、对外合作交流委员会现有三个国家重点学科即药物化学、生药学及药理学科，药学学科于2007年被认定为国家一级重点學科在教育部2012年学科评估中排名全国第一，于2017年入选教育部双一流建设学科2017年QS全球药学学科排名第24位。

学院在职职工179名有教授（研究员）45名、副教授（副研究员）47名，其中中国科学院院士2人国家“973”计划项目首席科学家3人，“长江学者奖励计划”特聘教授3名国家“青年千人计划”入选者6人，中组部首批青年拔尖人才1人百千万人才工程国家级人选1人,国家级有突出贡献中青年专家3人,国家杰出青年基金获得者7人，科技部创新人才推进计划中青年科技创新领军人才1人,科技部创新人才推进计划重点领域创新团队1个、教育部创新团队4个教育部跨世纪（新世纪）人才12人，国家优秀青年科学基金获得者5人北京市科技新星计划入选者4人，北京市优秀青年人才1人全国优秀教师1洺，北京市教学名师3名北京市优秀教师8名。博士生导师44名、硕士生导师54名具有博士学位的教师112名，占专任教师总数的">