检测18s到28srrnagene可以确定18s什么意思

小鼠18s rrna基因在卵巢和卵母细胞中的表达及其rnai载体构建

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内容提示:基于COI、18S+rDNA和28S+rDNA基因序列的馫樟齿喙象系统发育地位分析

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分类号 UDC 研究生学位论文 七种/株原甲藻的核糖体 18S、28S、5 和区域的克隆与变异分析 研究生姓名 王波 指导教师姓名 申请学位级别硕士 专业名称 海洋化学 论文答辩日期2005年6月2日 月 学位授予日期 2005年 中国海洋大学 七种/株原甲藻的核糖体18S、28S、58S及ITSI和ITS2基凶和区域的克隆与变芹分析 七种/株原甲藻的核糖体18S、28S、5.8S及l 因和区域的克隆与变异分析 摘要 rDNA 本研究对七利一/株原甲藻核糖体RNA基因 rDNA包括18SrDNA、5.8S 及28SrDNA的5’部分序列 及其ITS序列区进行扩增、克隆和测序。将序列信息 与從GenBank上下载的一些相关序列一起构建原甲藻属的系统树并将所得各序 列进行种株问遗传差异的比对,以期找出种问变异较大而种内保守的序列区域 用于设计属下种间特异性的分子探针。 在18S 列构建系统树结果发现原甲藻属可大致分为营浮游及浮游一底栖生活的和营底栖 生活的两大类群。17株原甲藻的1767个位点中有315个是变异位点属内各种株 间序列遗传距离最大为O.113,平均为0.049本研究所测的七株浮游原甲藻的序 列差异较小,但在一些区域也出现了种特异性的区段可以设计探针用于对原甲 藻的检测。 rDNA 由28S 5’端部分序列构建的系统树中可以明显看出大部分同种的不 同株系首先聚合,再和其他种相连;在此序列区域明显存在着保守区与高变异区 在高变区域,种内序列高度保守洏种间差异却很大,非常适合种特异性探针的 设计 于ITSl区及ITS2区的种间变异较大,仍不失为一个DNA探针设计的良好区域 综合七神/株原甲藻茬几个序列区段间的变异发现其28SrDNA5’端区、 为18SrDNA区的十几倍到几十倍;28SrDNA5’端部分序列区及ITS区的变异速 度比较适合原甲藻属内系统学分析。 对近姩来在我国东海引发赤潮的原因种原甲藻 Prorocentrumsp 进行的研究 表明其与尸dentatum CCMPl517 的18S 区及28SrDNA5’部分序列区仅各有一个碱基的差异,显示出了高度相似性:从序 列的比较我们初步认为它们可能是同+种当然其是否为同种还需分类学家进一 中国海_ 羊大学硕士研究生学位论文 步讨论。 分离自我国南海海域的海洋原甲藻在28S和ITS序列上与其他海域分离的海 洋原甲藻相差较大一其差异甚至超出有些原甲藻种间的差异;由电镜照片也可看 出形态上较为明显的差异。至于其差异足种间、还是种内不同形态种问的差异还 需进一步研究

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