用R拟合效果R方线型混合模型,选入不同的随机效应,怎么判断

  重复测量;混合效应线性模型;單因素方差分析;

  摘要:目的: 通过混合效应线性模型与单因素方差分析在重复测量资料中的应用比较旨在说明两方法在处理重复測量资料时的应用特点。方法: 用混合效应线性模型和单因素方差分析处理重复测量资料并比较结果: 混合效应线性模型和单因素方差汾析都是处理重复测量资料的重要统计方法,前者在选择协方差结构下可对重复测量资料的固定效应和随机效应参数及协方差矩阵进行参數估计和统计检验后者可对重复测量资料的固定效应做出统计推断。结论: 混合效应线性模型是处理重复测量资料的有力方法它对资料的协方差结构要求宽松,且结论可靠;单因素方差分析对资料的协方差结构有严格的限定

    关键词:重复测量;混合效应线性模型;单洇素方差分析;

  统计方法特点 重复测量数据(repeated measures data)是医学领域中常见的一种数据资料。所谓重复测量是指对同一个观察对象在不同时间點上进行的多次测量[1]由于重复测量资料是对同一受试对象的某一观察指标进行的重复观察所得的数据,同一受试者的观察数据间可能存在相关性一些传统的统计学方法如t检验等就不能充分揭示这一内在特点,有时甚至会导致错误的结论

    对重复测量资料的分析方法夶致可分为两类,即单变量统计分析方法和多变量统计分析方法[2]本研究通过选用多变量统计分析方法中的混合线性效应模型对一例題的分析,并与单因素方差分析进行比较来说明两种方法在处理重复测量资料中的应用特点。

    简单说混合效应线性模型就是所拟和的模型中既包含固定效应又包含随机效应,特别是个体内的数据结构的选择将对各因素的评价产生直接影响[3]

    混合效应线性模型是一般線性模型的扩展,其表达式为:

    X为已知设计矩阵β为固定效应参数构成的未知向量,ε是未知的随机误差向量,其元素不必为同独立分布了。在式(1)中Y,γ都是正态随机向量,其均值为0,方差阵分别为G与R二者之间不相关,因此Y的方差表达式为:

    当R=σ2I,Z=0时混合线性模型退化为一般线性模型。对G和R必须选择其协方差结构常用的结构有无结构(一般为协方差)、自回归(常用一阶)、复合对称(共同协方差加一对角え)等[4]。选择协方差矩阵的方法是在相同的结构模型下选择几个不同结构的协方差矩阵,从中选取似然比统计量(-2Log Likelihood)、Akaikes

下面用一实唎比较两种方法对处理重复测量资料时的特点:某药有新旧两种剂型为了比较这两种剂型的代谢情况,对16例病人服药后分别在0、4、8、12小時测得血药浓度(表1)问该药新旧剂型的血药浓度随时间变化的趋势是否一致。表1四个时间点某药新旧剂型血药浓度1用SAS软件的MIXED过程对固定效应和随机效应参数β、γ及协方差矩阵G、R进行估计和统计检验在本例中因变量为血药浓度,药物剂型、测量时间为固定效应受试者为隨机效应,同时选择合适的协方差结构以便在控制随机误差的基础上分析处理因素(药物剂型)对反应变量(血药浓度)的关系本例指萣为常用的无结构协方差(UN)和复合对称性协方差(CS)。

    模型拟合效果R方情况见表2表2模型配合统计量由表2可见,在UN结构下协方差配合的姒然比统计量-2Log Likelihood=398.0(表2),对无效模型的似然比检验χ2=134.43,ν=9 P<0.0001,说明模型拟合效果R方效果显著,模型较好地拟和了资料在CS结构下,似然比统計量-2Log

    在UN结构下的固定效应参数估计值及假设检验结果见表3、4

    由表4可知,在UN结构下不同处理组之间的差别无统计学意义(P=0.07551),不同测量时间点的血药浓度及处理组×时间点的交互作用的差别有统计学意义(P<0.0001)且这种交互作用主要体现在新剂型组。

    22应用SAS 软件的GLM过程对表1嘚资料处理结果见表5。由表5可见各处理组间时间因素间无差别,服从精确F分布本例F处理组=0.09,P=0.77可见其处理组主效应与时间因素无关

    主效应F时间点受协方差矩阵类型分布影响,球形检验的近似χ2=27.0284ν=5,对应P=0.0001不符合球形假定,故须对分子分母的自由度进行校正用H-F=0.8469作为校正因子,得:

    交互效应F处理组*F时间点也涉及时间点这一重复测量因子故也要对其分子分母的自由度进行校正:

    F0.05(2,36)=3.26<46.90,P<0.0001可认为不同組在不同时间点的血药浓度是不同的。表3固定效应的参数估计与比较表5单因素方差分析结果

    由两种方法对同一资料的处理可见两种方法嘚结论一致,但混合效应线性模型既考虑了观察对象在不同观察时点间的内在联系又考虑了观察值间的内部相关性,结论更为可靠

单洇素方差分析和混合效应线性模型都可用来处理重复测量资料,单因素方差分析是应用最小二乘法进行配合的一般线性模型此模型对协方差矩阵有着极端的假定,如果协方差阵的球形性得不到满足就必须进行多元方差分析或对F统计量进行校正,获得校正概率;混合效应線性模型是基于似然函数法的原理它对协方差矩阵的要求比单因素方差分析宽松,它允许资料存在某种相关性及协方差矩阵的多样性無须对自由度进行校正,能较好的适合重复资料的特点

    单因素方差分析很难估计参数,混合效应线性模型可以在所选择的协方差结构下估计固定效应及随机效应参数,还可以估计随机参数及随机误差的协方差阵G和R所以应用范围广,即使常规分析模型亦可作为其特例來应用[6]。

    在配合混合效应线性模型时要根据研究目的和资料特点选择一种模型然后在此模型下选择合适的协方差结构,只有选择合適的协方差结构对固定效应参数的估计和推论才有意义

    2陈长生,徐勇勇曹秀堂. 医学研究中重复测量数据的统计分析方法. 中国卫生统计,):55.

    4周天枢 洪荣涛, 陈崇帼,等. 用混合线性效应模型处理复合测量数据的方法分析脑血管病死亡率中国卫生统计, ):287.

    6周天枢洪荣涛, 陈崇帼,等. 鼡混合线性效应模型处理复合测量数据的方法分析脑血管病死亡率 中国卫生统计, ):288 .


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本文接上一篇R语言解读一元线性囙归模型在许多生活和工作的实际问题中,影响因变量的因素可能不止一个比如对于知识水平越高的人,收入水平也越高这样的一個结论。《数据分析人才培训》这其中可能包括了因为更好的家庭条件所以有了更好的教育;因为在一线城市发展,所以有了更好的工莋机会;所处的行业赶上了大的经济上行周期等《数据分析师考试》要想解读这些规律,是复杂的、多维度的多元回归分析方法更适匼解读生活的规律。
由于本文为非统计的专业文章所以当出现与教课书不符的描述,请以教课书为准本文力求用简化的语言,来介绍哆元线性回归的知识同时配合R语言的实现。
案例:黑色系期货日K线数据验证
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比如fm1中选了A.B.C.D四个随机效应fm2中选叻C.D两个随机效应,哪个模型更好
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