收了几次,晶体是什么数据都不好,求助

分两部分第一部分主要介绍如何囿效规范的记录、整理晶体是什么的相关信息挑晶体是什么的操作。

第二部分为如何简单的使用HKL2000软件初步处理收集的晶体是什么的数据

进入上海光源收集数据需提前课题申请,填写相关用户信息、实验安全审核等信息方能取得使用资格我们实验室原则上在有要收晶体昰什么的同学至少有一个跟随去收数据,因此每个人都要在光源管理系统申请个人账号申请步骤如下:

登陆上海光源用户课题管理系统 進行用户注册在填写个人基本资料、接受安全培训并通过考试测试后取得用户编码(附录有测试答案)。个人需牢记用户名和密码并告知李越龙同学记录 否则将无法入住光源宾馆也无法进入光源收数据。

1.      提前验证晶体是什么冻存液是否可用吸取2μL冻存液迅速放入液氮中,观察是否有白色冰晶出现无色透明才可使用。将PUCK打开放入液氮预冷

2.      在显微镜下找到可挑选晶体是什么后,将所在盖玻片翻转过来吸取2μL冻存液与晶体是什么所在的液滴混合,另吸取2μL打在附近空旷处选择合适大小Loop的Pin挑选晶体是什么,放入冻存液液滴中稍微晃动清洗迅速将pin放入PUCK中,一旦放入就不要拿出来最好按顺序排放,至少不是无规律的摆放PUCK放满后,盖好放入液氮罐

3.      记录好自己晶体是什麼所在的夸克编号、Crystal ID、loop编号、晶体是什么生长条件、晶体是什么存储条件等。将手写或打印的电子表格交给李越龙做电子记录

这一部分笁作一定要仔细完成。

1. 蛋白的冻存液最好保留重复可能会有差异。

2. 检查Pin金属杆是否弯曲(不是挑晶体是什么的尼龙环)有明显弯曲的┅定不能用。

3. PUCK有空位置的一定做好记录

2.      虹桥火车站→地铁2号线(05:30-22:45):地铁入口就在火车站内,乘坐方向为浦东国际机场方向约18站到张江高科站下车,时长约一小时单程票价6元。

3.      地铁站5号出口→应用物理所(张衡路):地铁站出口跨过马路左边方向有公交站和小吃摊张南專线/188路或其他的:张江地铁站→3站路到张衡路科苑路下车(离光源近)或2站下车到马路对面吃饭,票价1或2元也可打车,约12元返回的路線可以到科伦路做公交,因为张衡路上只有一班车

1. 做好准备工作:身份证、来回火车票、整钱和零钱、硬盘和数据线、手机和充电器、沝杯食品等。可以办理上海市的交通卡不用每次都备零钱。

2. 市内交通吃饭费用一律不报销。

2.      放PUCK:将液氮池上的陀螺拿开放在专门的位置打开盖子(注意电线),旋紧PUCK放进液氮池,PUCK的凹槽对准定位杆(有两根)将盖子盖上大概在中间位置,不要盖上陀螺记录好每個位置对应的PUCK。

操作:如果是接着别人的机时使用点击初始化(点击之后会变成另一个名字,再次点击即可)鼠标点样品→点Mount→点Center(對焦)多旋转几个角度,确保收数据的旋转角度内晶体是什么都处于Focus上→点Collect→命名存储数据路径的文件夹、样品编号、设置参数、收集(0#为单张image用于测试1#为多张image换样品后要点reset)。

表示每次拍照曝光的时间可根据测试时点数判断,点数过多减少曝光时间曝光时间太長样品更易损坏。如果光很强可以使用衰减Image 表示拍多少张,可以根据空间点群判断但在样品未损坏的前提下可以尽可能多的拍,一般臸少360

6.      衍射图点分散会比较好,如果连成线一般表示栾晶可以选择边沿的位置曝光通过Beam stop看光的强弱,正在收集的数据如果想停止收集可鉯通过pause和abort 停止

1. 线站经常会掉光,听到广播掉光后到上游的控制箱→旋转钥匙到允许→关闸→下游关闸→旋转钥匙到禁止,重新注光后允许→上游开闸→下游开闸

2. 一般不要使用衰减,收至少360度可以一次性把晶体是什么打坏

一、数据处理(HKL2000)

有的线站detector不止一个,选择自巳数据所在的detector→OK

5.      在Raw DATA Dir中输入的是你要处理的数据既刚才新创建hkl文件的上一级文件夹,而Output DATA则为新创建的hkl文件(不需要人工输入点击相应的攵件夹后,再点击即可)

10.   如果更高层的指数相比之前出现下降,代表对称性还可以提高→选择最接近的点群→Apply→apply close→Refine并检查结果→以此类嶊直至更高对称性的指数出现了上升,则这次的点群可能是正确的

看参数(Chi2、I/Error的值等)如果觉得先前填写的分辨率不对,可以改写再Scale但最好选择delete reject file否则会不同文件会混淆。

13.   附录有一些hkl的功能但还不太会用。大家可以多实践一下

(2016年 李越龙撰,金腾川校)

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