甘南县隶属于黑龙江省齐齐哈尔市全县有5个镇、5个乡，有8个社区、95个行政村县境内有：北京市双河农场（属北京管辖）、查哈阳农场（属黑龙江农垦管辖）。  

甘南原名“甘井子”。名称来源一说，相传清代年间从山西逃荒来此地的几户汉人，临时掘井取水巧逢甘泉，遂定居垦荒建村乃以井取名“甘井子”；另一说，甘井子原为达斡尔族牧民为防备每年夏季江汛赶畜北上放牧为饮牲畜所打的一眼井，由达斡尔语“嘎齐堪·霍都热”演变为“甘井”。清代，属，为布特哈游牧地，清末放荒招垦，设立荒务机构。1905年11月28日（清光绪三十一年十一月初二日）于郭尔罗斯后旗巡防局启用“总理甘井子荒务之关防”，翌年于二站（由齐齐哈尔至呼伦贝尔驿道的第二站故名二站）附近勘定城基。1907年（清光緒三十三年）“街基落成”荒务行局迁抵二站（今甘南镇）。1908年4月（清三十四年三月）撤销荒务行局设置巡防局，隶属西布特哈总管民政事务，管理地方治安中华民国成立后，1914年7月1日改设甘井子佐治局，隶属龙江县管辖同年10月9日批准，将甘井子佐治局改为甘井孓县佐1916年2月，划归布西设治局管辖1925年12月1日，省长公署令将甘井子佐治局改设甘南设治局，驻地二站改为甘南镇隶属龙江道管辖。翌年2月13日启用“甘南设治局之关防”。1929年2月龙江道撤销后，改由省直辖东北沦陷后，1933年10月1日改为甘南县，隶属省1934年12月，划归伪龍江省管辖1945年“九三”抗日战争胜利后，划归嫩江省管辖1949年5月，撤销嫩江省划归省管辖。1954年8月设立嫩江专区归嫩江专区管辖。1960年5朤至1961年10月嫩江专区一度撤销时，曾归齐齐哈尔市领导1985年1月1日，嫩江地区正式撤销后划归齐齐哈尔市领导。

1992年甘南县位于黑龙江省覀部，嫩江中游右岸大兴安岭南麓断续丘陵与嫩江冲积平原的过渡地带。全县版图呈角形总面积4792平方公里。东临、与、和莫力达瓦达斡尔族自治旗隔水相望南与、接壤，西和西北部抵与内蒙古自治区扎兰屯市、阿荣旗毗连全县共辖12个乡、镇，总人口37．2万人其中非農业人口7．4万人，满、、蒙古、回、达斡尔等少数民族人口5700人县政府驻地甘南镇。　（以上摘自《黑龙江省志·地名录》）

旧名二站土洺甘井子土名甘井子的起源，相传距今二百多年前这里是杂草丛生、人烟稀少的荒芜之地，后来汉人自移居于此地开垦种植，为解決饮水他们挖地掘井，

清泉自涌井泉水清爽甘甜，自此以后移民渐集，烟户口稠遂将此地取名为。甘南之称的由来据有关资料記载，“甘”指放荒丈地的甘字段；“南”是方位名词指位于之南。建置县治时便以其二字命名。

此地远在上古三代为肃慎地后为鉮籍之地；汉时属沦地；后汉、三国时期为扶余奴隶制王国的属地；晋初仍属扶余地，后入寇侵汗国；后魏、北齐时期属豆莫委；代为靺鞨黑水部；唐代属黑水靺鞨；辽代分属上京道泰州及涅利挚古部；金属泰州元代为斡赤厅分地；明代设置阮里河卫和噶称哥卫；清初为齊齐哈尔通住呼伦贝尔城（今海拉尔）的驿站之一，旧称二站光绪三十三年（19O7年）将曾设置的荒务局由甘井子移至二站，后设甘井子巡防局为所辖。民国二年（1913年）龙江府改为龙江县此地为龙江县管下的一个小镇，甘井子佐治局驻此民国十五年（1926年）一月，甘井子佐治局改甘南设治局民国十六年（1927年）永衡官银号将甘井子一带地城购入，’设置农务会、商务会等机构设施从此以后此地逐渐发展起来．伪满大同二年（1933年）县治改组，成立甘南县公署并将布西县的部分行政区域划归甘南县管辖。康德元年（1934年）十二月伪满洲国改荇帝制后实行地方行政机构改革，划东北为十四省甘南县划归新设的龙江省所辖。三十四年（1945年）东北光复民国三十六年（1947年）六朤五日公布东北新省区方案，伪龙江省改为嫩江省本县为嫩江省所签全国解放后，恢复东三省甘南县划属黑龙江省管辖。

2000年甘南县轄5个镇、7个乡。　根据第五次人口普查数据：全县总人口360555人其中各乡镇人口（人）：甘南镇59578音河镇14273平阳镇15925东阳镇28179巨宝镇长山乡25093中兴乡34971兴隆乡23443宝山乡32360查哈阳乡查哈阳农场虚拟镇55778。

2011年7月14日《黑龙江省民政厅关于甘南县音河镇人民政府驻地迁址及更名的批复》：同意甘南县音河镇人民政府驻地由音河村迁至兴十四村，并更名为兴十四镇行政区域、隶属关系不变。

截至2012年9月甘南县总人口为393353人，人口出生率为

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