在处理完一件酒醉驾驶事件之后一辆前线冲锋车以及车内的五名警员和武器装备在香港街头凭空消失，此事引起了香港警队高层的高度重视此时，恰逢适逢处长（王敏德 饰）出访国外因此由鹰派人物行动副处长李文彬（梁家辉 饰）担任这次案件的总指挥，并将这次行动命名“寒战3”第一次解救行動失败，警队之中怀疑出现内鬼又恰逢高层李文彬与刘家辉（郭富城 饰）矛盾激化。一时之间号称“最安全的城市”——香港危机四伏，警察被杀、爆炸案频发……到底谁才是真正的幕后黑手香港真的是“最安全的城市”吗？